直接修改源码，把找不到的那个头文件的路径修改为绝对路径，编译通过了，也能正常使用

pwd
/home/neo/tools/php-5.5.28/ext/mysqli
vim mysqli_api.c
把第36行的
#include "ext/mysqlnd/mysql_float_to_double.h"
修改为
#include "/home/neo/tools/php-5.5.28/ext/mysqlnd/mysql_float_to_double.h"